Для этого вам необходимо в настройках подкатегорий(Настройки - Раздел: Каталог товаров, Модуль: Товары, вкладка "Настройка отображения подкатегорий" ), в параметре Отображение подчиненных товаров установить значение Не отображать и использовать параметр Включать в список товары всех подкатегорий, начиная с уровня.